Fuasgladh Diagnostic TB agus DR-TB ùr-nodha le #Macro & Micro -Test!

Armachd Ùr airson Diagnosis Caitheamh agus Lorg an-aghaidh Dhrogaichean: Sreath Ùr Cuimsichte le Ginealach Ùr (tNGS) Co-cheangailte ri Ionnsachadh Inneal airson Diagnosis Tuberculosis Hypersensitivity

Aithisg litreachais: CCa: modail breithneachaidh stèidhichte air tNGS agus ionnsachadh innealan, a tha freagarrach dha daoine le nas lugha de chaitheamh bactaraidh agus fiabhras eanchainne caitheimh.

Tiotal tràchdas: Seicheamh agus ionnsachadh inneal an ath ghinealach le targaid tuberculous: ro-innleachd breithneachaidh ultra-mothachail airson tubular sgamhain gun stad agus fiabhras eanchainne tubular.

Ùine: 《Clinica Chimica Acta》

Ma tha: 6.5

Ceann-latha foillseachaidh: Faoilleach 2024

Còmhla ri Acadamaidh Saidheansan Oilthigh Shìona agus Ospadal Chest Beijing ann an Oilthigh Meidigeach Calpa, stèidhich Macro & Micro-Test modal breithneachaidh caitheamh stèidhichte air ginealach ùr de theicneòlas sreath targaidte (tNGS) agus dòigh ionnsachaidh inneal, a thug seachad fìor àrd. Thug cugallachd lorg airson caitheamh le glè bheag de bacteria agus fiabhras eanchainne a’ chaitheamh, seachad dòigh breithneachaidh hypersensitivity ùr airson breithneachadh clionaigeach air dà sheòrsa caitheamh, agus chuidich e le breithneachadh ceart, lorg an aghaidh dhrogaichean agus làimhseachadh a’ chaitheamh.Aig an aon àm, lorgar gum faodar plasma cfDNA an euslaintich a chleachdadh mar sheòrsa sampall iomchaidh airson samplachadh clionaigeach ann a bhith a ‘breithneachadh TBM.

Anns an sgrùdadh seo, chaidh 227 sampallan plasma agus sampallan de lionn cerebrospinal a chleachdadh gus dà bhuidheann clionaigeach a stèidheachadh, anns an deach na sampallan de bhuidheann sgrùdaidh obair-lann a chleachdadh gus modal ionnsachaidh inneal airson breithneachadh a’ chaitheamh a stèidheachadh, agus chaidh na sampallan de bhuidheann sgrùdaidh clionaigeach a chleachdadh gus dearbhadh a dhèanamh air a’ chaitheamh. modail diagnosachd.Chaidh a h-uile sampall a chuimseachadh an toiseach le amar sgrùdaidh glacaidh cuimsichte a chaidh a dhealbhadh gu sònraichte airson a’ chaitheamh Mycobacterium.An uairsin, stèidhichte air dàta seicheamh TB-tNGS, thathas a’ cleachdadh a’ mhodail craobh co-dhùnaidh gus tar-dhearbhadh 5-fhillte a dhèanamh air seataichean trèanaidh is dearbhaidh ciudha sgrùdaidh obair-lann, agus gheibhear stairsnich sgrùdaidh sampallan plasma agus sampallan lionn cerebrospinal.Tha an stairsneach a gheibhear air a thoirt a-steach do dhà sheata deuchainn de chiudha breithneachadh clionaigeach airson a lorg, agus tha coileanadh breithneachaidh an neach-ionnsachaidh air a mheasadh le lùb ROC.Mu dheireadh, chaidh am modail breithneachaidh den chaitheamh fhaighinn.

Fig. 1 diagram sgeamach de dhealbhadh rannsachaidh

Toraidhean: A rèir stairsnich sònraichte sampall DNA CSF (AUC = 0.974) agus sampall plasma cfDNA (AUC = 0.908) a chaidh a dhearbhadh san sgrùdadh seo, am measg sampaill 227, b ’e cugallachd sampall CSF 97.01%, b’ e an sònrachas 95.65%, agus bha cugallachd agus sònrachas sampall plasma aig 82.61% agus 86.36%.Anns an sgrùdadh air sampallan paidhir 44 de plasma cfDNA agus DNA fluid cerebrospinal bho euslaintich TBM, tha cunbhalachd àrd de 90.91% (40/44) ann an ro-innleachd sgrùdaidh an sgrùdaidh seo ann am plasma cfDNA agus DNA fluid cerebrospinal, agus is e an cugallachd 95.45% (42/44).Ann an cloinn le caitheamh sgamhain, tha ro-innleachd breithneachaidh an sgrùdaidh seo nas mothachail air sampallan plasma na toraidhean lorg Xpert de shamhlaichean sùgh gastric bho na h-aon euslaintich (28.57% VS 15.38%).

Fig. 2 Mion-sgrùdadh air coileanadh modal breithneachadh caitheamh airson sampallan sluaigh

Fig. 3 Toraidhean breithneachaidh de shamhlaichean càraideach

Co-dhùnadh: Chaidh dòigh sgrùdaidh hypersensitive airson caitheamh a stèidheachadh san sgrùdadh seo, a bheir seachad inneal sgrùdaidh leis an cugallachd lorg as àirde airson euslaintich clionaigeach le caitheamh oligobacillary (cultar àicheil).Faodaidh lorg air caitheamh hypersensitive stèidhichte air plasma cfDNA a bhith na sheòrsa sampall iomchaidh airson a bhith a’ lorg a’ chaitheamh gnìomhach agus fiabhras eanchainne tuberculous (tha sampallan plasma nas fhasa a chruinneachadh na lionn cerebrospinal airson euslaintich a tha fo amharas caitheamh eanchainn).

Ceangal tùsail: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?tro %3dihub

Ro-ràdh goirid air toraidhean lorg sreath caitheamh Macro & Micro-Deuchainn

Mar thoradh air an t-suidheachadh sampall iom-fhillte de dh ’euslaintich a’ chaitheamh agus diofar fheumalachdan, tha Macro & Micro-Test a ’toirt seachad seata iomlan de fhuasglaidhean NGS airson toirt a-mach liquefaction bho shampaill sputum, togail leabharlann Qualcomm agus sreath, agus mion-sgrùdadh dàta.Tha na toraidhean a’ còmhdach breithneachadh luath air euslaintich leis a’ chaitheamh, lorg an aghaidh dhrogaichean air a’ chaitheamh, a’ taipeadh mycobacterium tuberculosis agus NTM, breithneachadh hypersensitivity air caitheamh bacteria-àicheil agus daoine a’ chaitheamh, msaa.

Innealan lorg sreathach airson caitheamh agus mycobacteria:

Nì Àir ainm toraidh susbaint deuchainn toraidh seòrsa sampall modail iomchaidh
HWTS-3012 Agent release eisimpleir Air a chleachdadh ann an làimhseachadh sampaill sputum, fhuair e àireamh clàraidh den chiad ìre, Sutong Machinery Equipment 20230047. sputum
HWTS-NGS-P00021 Uidheam lorg meud Qualcomm airson caitheamh hypersensitive (dòigh glacaidh probe) Lorg hypersensitivity neo-ionnsaigheach (biopsy leaghan) airson caitheamh sgamhain àicheil bacteria agus nodules eanchainn;Chaidh mion-sgrùdadh a dhèanamh air na sampallan de dhaoine a bha fo amharas gu robh iad air an galar leis a’ chaitheamh no mycobacteria neo-chaitheamh le metagenomics sreath àrd-doimhneachd, agus an fhiosrachadh lorgaidh co-dhiù an robh a’ chaitheamh no mycobacteria neo-chaitheamh air an galar agus am prìomh fhiosrachadh mu strì an aghaidh dhrogaichean mycobacterium tuberculosis. air an toirt seachad. Fuil iomaill, lionn lavage alveolar, hydrothorax agus ascites, sampall puncture fòcas, lionn cerebrospinal. An dàrna ginealach
HWTS-NGS-T001 Pasgan lorgaidh mycobacterium agus dìon an aghaidh dhrogaichean (dòigh sreathachaidh leudachaidh ioma-fhillte) Deuchainn clò-sgrìobhaidh Mycobacterium, a’ toirt a-steach MTBC agus 187 NTMTha lorg an-aghaidh dhrogaichean de Mycobacterium tuberculosis a’ còmhdach 13 drogaichean agus 16 prìomh làraich mùthaidh de ghinean an aghaidh dhrogaichean. Sputum, lionn lavage alveolar, hydrothorax agus ascites, sampall puncture fòcas, lionn cerebrospinal. Àrd-ùrlar dùbailte dàrna / treas ginealach

Prìomh thachartasan: HWTS-NGS-T001 Inneal taidhpeadh mycobacterium agus lorg an aghaidh dhrogaichean (modh leudachaidh ioma-fhillte)

Ro-ràdh toraidh

Tha an toradh stèidhichte air na prìomh dhrogaichean ciad agus dàrna loidhne a tha air am mìneachadh ann an stiùiridhean làimhseachaidh TB WHO, macrolides agus aminoglycosides a thathas a’ cleachdadh gu cumanta ann an stiùiridhean làimhseachaidh NTM, agus tha na làraich strì an aghaidh dhrogaichean a’ còmhdach a h-uile buidheann de làraich co-cheangailte ri strì an aghaidh dhrogaichean. Catalog mutation iom-fhillte WHO Mycobacterium tuberculosis, a bharrachd air ginean dìon dhrogaichean eile agus làraich mùthaidh a rèir sgrùdadh agus staitistig litreachasan le sgòr àrd aig an taigh agus thall thairis.

Tha comharrachadh clò-sgrìobhaidh stèidhichte air na sreathan NTM air a bheil geàrr-chunntas ann an stiùireadh NTM a chaidh fhoillseachadh le Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases agus co-aontachd eòlaichean.Faodaidh na primers clò-sgrìobhaidh dealbhaichte leudachadh, òrdugh agus comharrachadh barrachd air gnèithean 190 NTM.

Tro theicneòlas leudachaidh ioma-fhillte PCR cuimsichte, chaidh na ginean genotyping agus ginean an aghaidh dhrogaichean de Mycobacterium a mheudachadh le ioma-fhillte PCR, agus chaidh am cothlamadh amplicon de ghinean targaid a lorgadh.Faodar na toraidhean meudaichte a thogail a-steach do leabharlannan sreath àrd-threabhadh dàrna ginealach no treas ginealach, agus faodar a h-uile àrd-ùrlar sreath dàrna ginealach is treas ginealach a dhol tro shreath àrd doimhneachd gus fiosrachadh sreath de ghinean targaid fhaighinn.Le bhith a’ dèanamh coimeas ris na mùthaidhean aithnichte a tha anns an stòr-dàta iomraidh togte (a’ toirt a-steach catalog mùthaidh iom-fhillte WHO Mycobacterium tuberculosis agus an dàimh a th’ aige ri strì an aghaidh dhrogaichean), chaidh na mùthaidhean co-cheangailte ri strì an aghaidh dhrogaichean no so-leòntachd dhrogaichean an-aghaidh a’ chaitheamh a dhearbhadh.Còmhla ris an fhuasgladh làimhseachaidh sampall sputum fèin-fhosgailte de Macro & Micro-Test, chaidh an duilgheadas a thaobh èifeachdas meudachaidh searbhag niuclasach ìosal de shamhlaichean sputum clionaigeach (deich tursan nas àirde na dòighean traidiseanta) fhuasgladh, gus an tèid lorg fhaighinn air sreath an aghaidh dhrogaichean. air a chuir gu dìreach ri sampallan sputum clionaigeach.

Raon lorgaidh toraidh

34ginean co-cheangailte ri strì an aghaidh dhrogaichean de18drogaichean an-aghaidh caitheamh agus6Chaidh drogaichean NTM a lorg, a’ còmhdach297làraichean strì an aghaidh dhrogaichean;Deich seòrsaichean de Mycobacterium tuberculosis agus barrachd air190Chaidh seòrsaichean NTM a lorg.

Clàr 1: Fiosrachadh mu 18+6 Drogaichean +190+NTM

Buannachd toraidh

Freagarrachd clionaigeach làidir: faodar na sampallan sputum a lorg gu dìreach le àidseant fèin-leaghadh às aonais cultar.

Tha an obair deuchainneach sìmplidh: tha a ’chiad chuairt de dh’ obair leudachaidh sìmplidh, agus tha togail an leabharlainn air a chrìochnachadh ann an 3 uairean, a leasaicheas èifeachdas obrach.

Clò-bhualadh coileanta agus strì an aghaidh dhrogaichean: a’ còmhdach làraich clò-sgrìobhaidh agus dìon dhrogaichean MTB agus NTM, a tha nam prìomh phuingean de dhragh clionaigeach, clò-sgrìobhadh ceart agus lorg strì an aghaidh dhrogaichean, a’ toirt taic do bhathar-bog anailis neo-eisimeileach, agus a’ gineadh aithisgean anailis le aon bhriogadh.

Co-fhreagarrachd: co-chòrdalachd toraidh, ag atharrachadh gu àrd-ùrlaran ILM agus MGI / ONT prìomh-shruthach.

Sònrachadh toraidh

Còd bathar ainm toraidh Àrd-ùrlar lorgaidh sònrachaidhean
HWTS-NGS-T001 Inneal lorgaidh mycobacterium agus dìon an aghaidh dhrogaichean (dòigh leudachaidh ioma-fhillte) ONT, Illumina, MGI, Salus pro 16/96rxn

Ùine puist: Faoilleach-23-2024