Armachd Ùr airson Breithneachadh a’ Chnatain Mhòir agus Lorgaidh Seasmhachd Dhrogaichean: Ginealach Ùr de Shreidheadh Targaideach (tNGS) Còmhla ri Ionnsachadh Innealan airson Breithneachadh air Hipir-mhothachadh a’ Chnatain Mhòir
Aithisg litreachais: CCa: modail breithneachaidh stèidhichte air tNGS agus ionnsachadh innealan, a tha freagarrach do dhaoine le nas lugha de thubaist bacteriach agus meningitis tuberculous.
Tiotal an tràchdais: Sreathachadh an ath ghinealaich agus ionnsachadh innealan a tha ag amas air a’ chatastroph: ro-innleachd breithneachaidh air leth mothachail airson tiùban sgamhain gann agus meningitis tiùbalach.
Ùine: 《Clinica Chimica Acta》
MA: 6.5
Ceann-latha foillseachaidh: Faoilleach 2024
Còmhla ri Acadamaidh Saidheansan Oilthigh Shìona agus Ospadal Ciste Beijing aig Oilthigh Meidigeach Calpa, stèidhich Macro & Micro-Test modail breithneachaidh a’ chaitheamh stèidhichte air an ginealach ùr de theicneòlas sreath cuimsichte (tNGS) agus dòigh ionnsachaidh innealan, a thug seachad cugallachd lorg fìor àrd airson a’ chaitheamh le glè bheag de bacteria agus meningitis tuberculous, a thug seachad dòigh ùr breithneachaidh hypersensitivity airson breithneachadh clionaigeach air dà sheòrsa a’ chaitheamh, agus a chuidich le breithneachadh ceart, lorg strì an aghaidh dhrogaichean agus làimhseachadh a’ chaitheamh. Aig an aon àm, chaidh faighinn a-mach gum faodar cfDNA plasma an euslaintich a chleachdadh mar sheòrsa sampall freagarrach airson samplachadh clionaigeach ann a bhith a’ breithneachadh TBM.
Anns an sgrùdadh seo, chaidh 227 sampall plasma agus sampallan lionn cerebrospinal a chleachdadh gus dà chohort clionaigeach a stèidheachadh, anns an deach na sampallan cohort breithneachaidh obair-lann a chleachdadh gus modail ionnsachaidh innealan airson breithneachadh a’ chaitligeach a stèidheachadh, agus chaidh na sampallan cohort breithneachaidh clionaigeach a chleachdadh gus am modail breithneachaidh a chaidh a stèidheachadh a dhearbhadh. Chaidh na sampallan uile a thargaideadh an toiseach le amar probe glacaidh targaideach a chaidh a dhealbhadh gu sònraichte airson Mycobacterium tuberculosis. An uairsin, stèidhichte air dàta sreath TB-tNGS, thathas a’ cleachdadh modail a’ chraoibh cho-dhùnaidh gus dearbhadh-crois 5-fhillte a dhèanamh air na seataichean trèanaidh is dearbhaidh den chiudha breithneachaidh obair-lann, agus gheibhear stairsnich breithneachaidh nan sampallan plasma agus nan sampallan lionn cerebrospinal. Tha an stairsneach a gheibhear air a thoirt a-steach do dhà sheata deuchainn de chiudha breithneachaidh clionaigeach airson lorg, agus tha coileanadh breithneachaidh an neach-ionnsachaidh air a mheasadh le lùb ROC. Mu dheireadh, fhuaireadh modail breithneachaidh a’ chaitligeach.
Figear 1 diagram sgemataigeach de dhealbhadh rannsachaidh
Toraidhean: A rèir nan stairsnich sònraichte airson sampall DNA CSF (AUC = 0.974) agus sampall cfDNA plasma (AUC = 0.908) a chaidh a dhearbhadh san sgrùdadh seo, am measg 227 sampall, b’ e 97.01% cugallachd sampall CSF, b’ e 95.65% an sònrachas, agus b’ e 82.61% agus 86.36% cugallachd agus sònrachas sampall plasma. Ann an anailis air 44 sampallan paidhir de cfDNA plasma agus DNA lionn cerebrospinal bho euslaintich TBM, tha cunbhalachd àrd de 90.91% (40/44) aig ro-innleachd breithneachaidh an sgrùdaidh seo ann an cfDNA plasma agus DNA lionn cerebrospinal, agus tha an cugallachd 95.45% (42/44). Ann an clann le a’ chnatan mhòr sgamhain, tha ro-innleachd breithneachaidh an sgrùdaidh seo nas mothachaile do shampaill plasma na toraidhean lorg Xpert de shampaill sùgh gastric bho na h-aon euslaintich (28.57% VS 15.38%).
Figear 2 Coileanadh mion-sgrùdaidh modail breithneachaidh a’ chnatan-mhòr airson sampallan sluaigh
